Все учебные кабинеты оборудованы и оснащены наглядными пособиями, учебной мебелью, соответствующей возрасту и образовательным задачам, персональным компьютером учителя. Большинство учебных кабинетов оснащены копировальной техникой и интерактивной доской для обеспечения индивидуализации учебного процесса.
Для занятий физической культурой в школе оборудованы спортивный уголок. В 2014 году на территории школы была возведена спортивно- игровая площадка. Для занятий физкультурой на улице, кроме школьной площадки, используются стадион. Спортивный уголок оснащен различным спортивным инвентарём: шведской стенкой, турниками, гимнастическими скамейками.
Имеется тренажерная зона, которая оснащена велотренажерами, оборудованием для занятий фитнесом, аэробикой
Условия питания обучающихся, в том числе инвалидов и лиц с ограниченными возможностями здоровья.
Для обучающихся МАОУ СОШ №65 г. Томска предусматривается организация горячего питания. Пищеблок школы осуществляет производственную деятельность в полном объёме 6 дней – с понедельника по субботу включительно. Классные руководители сопровождают обучающихся в столовую. Столовая расположена на 1 этаже.
Обеспечение питанием учащихся начальных классов является организованным, с предварительным накрыванием по заявке классного руководителя. Учащиеся среднего и старшего звена могут получить горячее питание, как организованно по предварительной заявке классного руководителя, согласно цикличному меню, так и индивидуально, самостоятельно выбрав блюда на перемене.